સાઇટ દ્વારા દિગ્દર્શીત Nuclease (SDN) જીનોમ એડિટીંગમાં વિવિધ ડીએનએ-કટીંગ એન્ઝાઇમનો ઉપયોગ સામેલ છે (ન્યુક્લીઝ) જે વિવિધ ડીએનએ બંધનકર્તા પ્રણાલીઓની શ્રેણી દ્વારા પૂર્વનિર્ધારિત સ્થાન પર ડીએનએને કાપવા માટે નિર્દેશિત કરવામાં આવે છે.. કટ કર્યા પછી, સેલની પોતાની ડીએનએ રિપેર મિકેનિઝમ બ્રેકને ઓળખે છે અને નુકસાનનું સમારકામ કરે છે, કોષોમાં કુદરતી રીતે હાજર હોય તેવા બે માર્ગોમાંથી એકનો ઉપયોગ કરીને:
- નોન-હોમોલોગસ એન્ડ-જોઇનિંગ (NHEJ): કટ ડીએનએ ફરી જોડાય છે, પરંતુ આ કરતી વખતે કેટલાક બેઝપેર ખાઈ જાય છે અથવા ઉમેરવામાં આવે છે પરિણામે રેન્ડમ નાના કાઢી નાખવામાં આવે છે (સુધી 20) અથવા ઉમેરાઓ (થોડા બેઝપેર) કટ સાઇટ પર ન્યુક્લિયોટાઇડ્સ.
- હોમોલોજી-નિર્દેશિત સમારકામ (HDR): દાતા ડીએનએ કે જે ઇચ્છિત ફેરફાર કરે છે અને લક્ષ્ય સાઇટ સાથે સમાનતા ધરાવે છે તેનો ઉપયોગ કટ સાઇટ પર આ ફેરફારને રજૂ કરવા માટે થાય છે.. આ રીતે તમે ચોક્કસ ઇરાદાપૂર્વક દાખલ કરી શકો છો, ફેરફારો અથવા કાઢી નાખવા.

જીનોમ સંપાદન અનિચ્છનીય લક્ષણ અથવા (પુનઃ)ઇચ્છિત લક્ષણનો પરિચય.
ન્યુક્લિઝ મધ્યસ્થ જીનોમ સંપાદન તકનીકોનો સમાવેશ થાય છે:
