Situs-Directed Nuclease (SDN) pengeditan genom melibatkan penggunaan enzim pemotong DNA yang berbeda (nucleases) yang diarahkan untuk memotong DNA pada lokasi yang telah ditentukan oleh berbagai sistem pengikatan DNA yang berbeda. Setelah pemotongan dilakukan, mekanisme perbaikan DNA sel itu sendiri mengenali kerusakan dan memperbaiki kerusakan, menggunakan salah satu dari dua jalur yang secara alami ada dalam sel:
- penggabungan akhir non-homolog (NHEJ): DNA yang dipotong disatukan kembali, tetapi saat melakukan ini, beberapa pasangan dasar dapat dimakan atau ditambahkan yang mengakibatkan penghapusan kecil secara acak (hingga 20) atau penambahan (beberapa pasangan dasar) nukleotida di lokasi pemotongan.
- perbaikan yang diarahkan oleh homologi (HDR): DNA donor yang membawa perubahan yang diinginkan dan memiliki homologi dengan situs target digunakan untuk memperkenalkan perubahan ini di situs yang dipotong. Dengan cara ini Anda dapat memperkenalkan penyisipan khusus yang disengaja, perubahan atau penghapusan.
Pengeditan genom memungkinkan ketukan yang disengaja dan tepat dari sifat yang tidak diinginkan atau (ulang)pengenalan sifat yang diinginkan.
Teknik pengeditan genom yang dimediasi nuclease meliputi: