Site-Directed Nuclease (SDN) Ang pag-edit ng genome ay nagsasangkot ng paggamit ng iba't ibang mga DNA-cutting enzymes (mga nucleases) na nakadirekta upang i-cut ang DNA sa isang paunang natukoy na lokasyon sa pamamagitan ng isang hanay ng iba't ibang mga DNA binding system. Matapos gawin ang hiwa, kinikilala ng sariling mekanismo ng pag-aayos ng DNA ng cell ang pagkasira at inaayos ang pinsala, gamit ang isa sa dalawang pathway na natural na naroroon sa mga cell:
- non-homologous end-joining (NHEJ): Ang pinutol na DNA ay muling pinagsama, ngunit habang ginagawa ito, maaaring kainin o idagdag ang ilang basepair na magreresulta sa mga random na maliliit na pagtanggal (hanggang 20) o mga karagdagan (ilang basepairs) ng mga nucleotide sa lugar na pinutol.
- pagkumpuni na nakadirekta sa homology (HDR): isang donor DNA na nagdadala ng nais na pagbabago at may homology sa target na site ay ginagamit upang ipakilala ang pagbabagong ito sa cut site. Sa ganitong paraan maaari kang magpakilala ng mga tukoy na sinadyang pagpapasok, pagbabago o pagtanggal.
Ang pag-edit ng genome ay nagbibigay-daan sa sinadya at tumpak na pag-knock out ng isang hindi kanais-nais na katangian o ang (re)pagpapakilala ng ninanais na katangian.
Kasama sa nuclease mediated genome editing techniques: