Sự khác biệt giữa GM- và không biến đổi gen loại cây đã được đánh giá quá cao, ngay sau khi kỹ thuật di truyền đã được áp dụng để nhân giống cây trồng. Sự hiểu biết phản bác các nhà khoa học và đặc biệt là trong cộng đồng đánh giá rủi ro là cây trồng GM gây ra một số rủi ro mới, chưa từng có trong cây trồng thông thường nuôi. Này sau đó ngưng tụ trong Liên Hiệp Quốc Nghị định thư Cartagena về an toàn sinh học, mà cần phải được xem xét lại trong các khía cạnh cơ bản nhất định.
Sau khi giai đoạn đầu đánh giá rủi ro, bao gồm cả các kết quả của Hội nghị Asilomar về an toàn sinh học, một phân chia đầu trong đánh giá rủi ro khái niệm cơ bản phát triển giữa Canada, Mỹ và châu Âu trong đó có một phần lớn các quốc gia ký Liên Hợp Quốc. Các nhà nghiên cứu như Werner Arber, dựa trên những hiểu biết phân tử trước đó và trên kinh nghiệm của mình trong yêu cầu kỹ thuật di truyền có liên quan đến quá trình phân tử không có sự khác biệt giữa kỹ thuật di truyền và đột biến tự nhiên. Dương chia này có thể được giải quyết với một số thủ tục tố tụng pháp sáng tạo hơn.