Razlika med GM- in ne-GM-rastline je precenjena, takoj, ko je bil genski inženiring uporablja za vzrejo rastlin. Nesporno razumevanje med znanstveniki in zlasti v skupnosti za ocenjevanje tveganja je, da gensko spremenjeni pridelki predstavljajo nekatera nova tveganja, brez primere v konvencionalno gojenih pridelkov. Ta je nato kondenzira v Združenih narodih Kartagenski protokol o biološki varnosti, ki mora biti zaslišan v nekaterih osnovnih vidikov.
Po zgodnji fazi ocene tveganja, vključno z rezultati konference Asilomar o biološki varnosti, zgodaj razkorak v oceni osnovnih konceptov tveganja razvile med Kanado, ZDA in Evropa, vključno z večino držav podpisnic ZN. Raziskovalci, kot so Werner Arber, na podlagi predhodnih molekularnih spoznanj in lastnih izkušenj v genskem inženiringu trditev, da v zvezi s molekularnih procesov ni razlike med gensko inženirstvo in naravne mutacije. To čezatlantsko razkorak je mogoče rešiti z nekaj več inovativnih zakonodajnih postopkov.